Les conditions humides du matin ont laissé place à une piste de Motegi séchante après le déjeuner japonais. Stoner en a profité pour reprendre les choses en main bien que souffrant toujours de son poignet fracturé, tandis que Pedrosa s'est offert une remontée probante au classement.L'Espagnol, en difficulté sur le mouillé, n'a pas été loin de s'offrir son premier meilleur chrono avec ses nouveaux pneus. Et puisque Dani est performant sur le sec tandis que Hayden marche sur l'eau, Honda peut espérer un bon week end à domicile.Rossi regarde tout ça de sa troisième place assurant par là un triplé des Bridgestone. Dovizioso néanmoins assure à Michelin une place parmi le groupe de tête juste devant Capirossi, qui a aussi fait un beau redressement, et notre Guintoli, bon dans toutes les conditions.Randy est dans les dix alors que les M.1 en bibendum ont loupé l'exercice, sombrant au fond de la feuille des temps. Vermeulen et De Angelis ont également marqué le pas.Chronos1. Casey Stoner Ducati (B) 1:48.1212. Dani Pedrosa Honda (B) 1:48.194 + 0.0733. Valentino Rossi Yamaha (B) 1:48.510 + 0.3894. Andrea Dovizioso Honda (M) 1:48.770 + 0.6495. Loris Capirossi Suzuki (B) 1:48.779 + 0.6586. Sylvain Guintoli Ducati (B) 1:48.794 + 0.6737. Nicky Hayden Honda (M) 1:48.800 + 0.6798. Marco Melandri Ducati (B) 1:48.945 + 0.8249. Toni Elias Ducati (B) 1:48.974 + 0.85310. Randy De Puniet Honda (M) 1:49.149 + 1.02811. Shinya Nakano Honda (B) 1:49.190 + 1.06912. John Hopkins Kawasaki (B) 1:49.197 + 1.07613. Colin Edwards Yamaha (M) 1:49.344 + 1.22314. James Toseland Yamaha (M) 1:49.424 + 1.30315. Jorge Lorenzo Yamaha (M) 1:49.505 + 1.38416. Chris Vermeulen Suzuki (B) 1:49.664 + 1.54317. Anthony West Kawasaki (B) 1:50.131 + 2.01018. Alex De Angelis Honda (B) 1:50.158 + 2.03719. Kousuke Akiyoshi Suzuki (B) 1:50.879 + 2.758